第213章 计算生物学研究 四(2/2)
刘伟愣了一下,摇摇头:“不会,正常人起码从0.05起跳。”
“这就对了。”徐辰指了指脑袋,“生物系统的复杂性就在於它的非线性。那个能打开宝库的『芝麻开门』的频率,往往藏在人类直觉的盲区里。第一次我大意了,把地图画错了一角。现在地图修好了,除了跟著地图走,我们在黑暗中別无他法。”
“相信数学。在混沌的生物系统里,它是唯一的火把。”
……
调整方案后,实验继续进行。
“徐神,这组菌长得有点慢啊,od600才0.4,是不是诱导剂加多了要不要补点葡萄糖”刘伟看著分光光度计的读数,有些担忧。
“不,別动。”徐辰盯著电脑屏幕上的模擬曲线,冷静地说道,“模型显示这是正常的代谢切换期。细胞正在重组胞內的酶系,適应新的碳通量分配。这是黎明前的黑暗,再等两小时,od值会指数级上升。”
徐辰心里暗道:要是这时候加了葡萄糖,就会触发『碳分解代谢物阻遏效应』,之前的调控就全白费了。生物学直觉有时候会骗人,就像女人的第六感,虽然准,但偶尔也会把你带沟里去。但微分方程不会,它是绝对理性的渣男,只讲逻辑,不讲感情。
“老刘,这组样品的淬灭时间要精確到秒,准备好液氮。我们要捕捉的是胞內代谢物的瞬时浓度。”
“放心,掐表吧。”
……
两周后,凌晨两点。
实验室里只剩下高效液相色谱仪(hplc)发出的低沉嗡嗡声。这台昂贵的仪器正在分离发酵液中的各种有机酸,並將它们转化为电信號。
当最后一组样品的分析图谱在屏幕上缓缓绘製出来时,原本困得直打哈欠、手里还捏著半个麵包的刘伟,突然猛地凑近屏幕,眼珠子瞪得溜圆。
“臥……臥槽!”
“怎么了”徐辰凑过来。
“徐辰,你过来看!”刘伟指著屏幕上那个高耸入云的特徵峰,声音都变调了,“这是琥珀酸的峰你確定没把標样当样品打进去这峰面积……都快衝出屏幕了!”
“这就是发酵液的上清。”徐辰走过来,看了一眼保留时间和峰面积,嘴角微微上扬。
“这產量……比对照组提高了整整50%!”刘伟难以置信地调出了另一张图——细胞生长曲线,“最离谱的是,这菌体密度居然跟野生型几乎一样!这不科学啊!”
刘伟转过头,像看怪物一样看著徐辰,手里抓著滑鼠都在抖。
“这完全违背了代谢工程的常识!你让马儿跑,还不让马儿吃草你把碳源都拿去合成產物了,这细菌靠什么长这么快难道你给启动子施了魔法还是说这大肠桿菌成精了”
“不是魔法,是数学。”
徐辰指著图谱上那几个不起眼的小峰,那是副產物乙酸和乳酸的峰,此刻它们低得几乎看不见。
“模型预测,当我们把pfk的活性压低到38%时,细胞內的代谢流会发生一种奇妙的『分流效应』。原本流向乙酸和乳酸这些『垃圾產物』的碳源被截流了,原本用於无效循环的能量被节省下来,正好弥补了合成琥珀酸的消耗。”
刘伟张了张嘴,看著徐辰那张平静的脸,最后只憋出一句话:
“服了。以后谁再跟我说生物是实验科学,我跟谁急。这分明就是算命科学……”