第211章 计算生物学研究 二（2/2）

“如果强行控制，信號会在环路里无限放大或震盪，导致系统崩溃。”

为了解决这个问题，徐辰试图切断这些环。但每一次切断，都可能破坏生物体原本的稳態，导致模型中的细胞“死亡”。

这在数学上演变成了一个np-hard问题，也就是非確定性多项式困难问题。

通俗点说，就是这个问题的计算量隨著网络规模的增加呈指数级爆炸。要在几千个节点、几万条边构成的复杂网络中，找到一组破坏性最小的切断方案，如果用穷举法，哪怕把全世界的计算机都连起来算到宇宙毁灭，也算不完。

整整一周，徐辰都被困在这个逻辑死锁里。

直到第七天的黄昏，他盯著窗外盘旋的鸽群，看著它们在空中画出一个个圆圈，突然意识到自己钻了牛角尖。

“我不需要切断所有环。我只需要找到那些『环的交集』。”

“反馈顶点集！”

这是一个图论中的经典概念。只要移除这个集合中的节点，图就会变成一个“有向无环图”。

“我不需要摧毁环路，我只需要在环路的关键节点上设立『关卡』。”

“只要控制这极少数的几个点，就能像掐住蛇的七寸一样，打破所有的循环死锁，將复杂的有环图强制降格为线性可控系统。这样，经典的控制理论就能长驱直入！”

思路一通，豁然开朗。

“模擬退火算法……启动。”

他飞快地在笔记本上敲下最后一段python代码，將寻找最小fvs的任务交给了算力。

屏幕上的光標疯狂闪烁，gpu的散热风扇发出咆哮，仿佛在计算著上帝的密码。

十分钟后，喧囂归於沉寂。

屏幕上弹出了最终的计算结果。没有密密麻麻的数据流，只有几个孤零零的代號，但每一个名字背后，都代表著控制细胞生死的“咽喉”：

[关键节点识別完成]

＞节点一：pfk（磷酸果糖激酶）——糖酵解途径的“总油门”

＞节点二：pyk（丙酮酸激酶）——能量生成的“最后阀门”

＞...

徐辰看著这几个名字，长长地呼出一口浊气。

这就对了。

在传统的生物学认知里，pfk和pyk这几个酶虽然地位显赫，被称为代谢通路的“限速步骤”，但也是出了名的“烫手山芋”。因为它们处於网络的枢纽位置，牵一髮而动全身，稍微调节不当，就会导致代谢流紊乱，细胞直接崩溃。所以，大多数研究者对它们都是敬而远之，或者只敢做些微小的修补。

但在徐辰的数学模型里，这几个酶不再是不可触碰的禁区，而是撬动整个庞大网络的“阿基米德支点”。

他的模型不仅锁定了它们，更计算出了那个极其狭窄却又真实存在的“操作窗口”。只要在这个窗口內进行精准的扰动，就能四两拨千斤，在不破坏系统稳態的前提下，彻底改变代谢流的走向。

这几个点，就是他要找的“总开关”。

“理论闭环完成了。”

“接下来，就是实验验证了。”